苹果EST数据分析平台的构建及初步应用

	苹果EST数据分析平台的构建及初步应用
	岳鹏 1,2; 钟翡 1; 雷恒久 1; 柳爱玲 1; 刘兰英 3; 李天红 1
	2011-08-15
发表期刊	中国农业大学学报
ISSN	1007-4333
卷号	16 期号:04 页码:134-140
摘要	为更有效地利用苹果EST公共数据资源,方便信息交流与共享,本研究构建了苹果EST数据分析平台Malus domestica Micro-Workstation,并整合了专为苹果定制的序列延伸系统。该数据分析平台具有本地信息查询、序列简单注释和短序列延伸等功能。以所建平台为辅助工具,从已公布的324 308条苹果EST序列中预测干旱胁迫相关基因,共有1 979条EST延伸序列可能与干旱胁迫相关,其中预计下调的数量为959,上调的为1 020,共计109条干旱胁迫相关序列可能具有全长编码区;从细胞组分、分子功能和生物过程等3方面将这些延伸序列归类,为进一步克隆苹果干旱胁迫相关基因提供线索。
关键词	苹果 EST 数据分析平台序列延伸干旱胁迫
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收录类别	北大核心 ; CSCD
语种	中文
资助项目	国家自然科学基金资助项目(30871696);公益性行业(农业)科研专项经费项目(201003021)
原始文献类型	学术期刊
文献类型	期刊论文
条目标识符	http://ir.library.ouchn.edu.cn/handle/39V7QQFX/88346
专题	国家开放大学河北分部
作者单位	1.中国农业大学农学与生物技术学院/北京市果树逆境生理与分子生物学重点开放实验室; 2.张家口广播电视大学; 3.北京市海淀区植物组织培养技术实验室
第一作者单位	国家开放大学河北分部
推荐引用方式 GB/T 7714	岳鹏,钟翡,雷恒久,等. 苹果EST数据分析平台的构建及初步应用[J]. 中国农业大学学报,2011,16(04):134-140.
APA	岳鹏,钟翡,雷恒久,柳爱玲,刘兰英,&李天红.(2011).苹果EST数据分析平台的构建及初步应用.中国农业大学学报,16(04),134-140.
MLA	岳鹏,et al."苹果EST数据分析平台的构建及初步应用".中国农业大学学报 16.04(2011):134-140.